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学科主题感染疾病科
拉米夫定治疗中乙型肝炎病毒基因序列变异特点及其准种研究
其他题名Variants and quasispecies of reverse franscriptase region in polymerase gene of hepatitis B virus during lamivudine treatment
田国保1; 曾争1; 黄中红1; 陆海英1; 于敏1; 公维波1; 王东1; 斯崇文1
关键词种特异性 肝炎病毒 拉米夫定 乙型 序列分析 Hepatitis b Virus Species Specificity Lamivudine Sequence Analysis
刊名中华实验和临床病毒学杂志
2011
DOI10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2011.01.009
25期:1页:23-25
收录类别中国科技核心期刊 ; CSCD
文章类型Journal Article
摘要目的 研究拉米夫定治疗中乙型肝炎病毒(HBV)逆转录酶区核苷酸序列变异、特点、含量及其与基因型和病毒载量的关系.方法 普通DNA测序法检测拉米夫定治疗的117份慢乙肝患者血清HBV逆转录酶区基因序列及其基因型;其中99份用TaqMan法定量HBV DNA;64份用焦磷酸测序(Pyrosequencing)检测YMDD基序中碱基的频率.结果 HBV YMDD变异组中C型43例,B型10例,A/B混合型1例;YMDD不变异组中C型54例,B型8例,D型1例,HBV DNA含量平均对数值在变异组和不变异组分别为:6.5699和6.6165;YMDD变异与其基因型及病毒载量无统计学意义;rtL180M位点变异与rtM204I/V位点变异高度相关;并且HBV野生株与变异株均同时存在.结论 结合两种测序方法 可以用来研究拉米夫定治疗中HBV基因序列变异情况及对YMDD耐药株进行定量. Objective To investigate the variants and quasispecies of reverse transcriptase region in polymerase gene of hepatitis B virus (HBV) during lamivudine treatment and their relationship with genotypes and viral loads. Methods HBV DNA of 117 chronic hepatitis B patients treated with lamivudine were amplified by using PCR. The PCR products including the YMDD motif were sequenced by DNA sequencer, of which, HBV DNA viral loads of 99 patients were determined by real-time PCR and 64 samples were sequenced by Pyrosequencing. Results In HBV YMDD variant group and no variant group, the HBV genotypes were 79.6% and 86. 7% of type C, 18.5% and 12. 7% of type B, 1.9% of A/B recombinant type and 2.6% of type D, respectively. The viral loads ( log 10) were 6. 5699 and 6. 6165, respectively.There was no significant difference in HBV genotypes and viral loads between these two groups. The rtL180M variant was found in association with the rtM204I/V variant, HBV variants and wild-type in YMDD motif all existed together in these two groups. Conclusions HBV variants (quasispecies) in YMDD motif could be quantified by pyrosequencing, which would be a feasible measure during nucleoside or nucleotide analogue therapy against chronic HBV infection.
语种中文
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文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.bjmu.edu.cn/handle/400002259/41790
专题北京大学第一临床医学院_感染疾病科
北京大学第二临床医学院_肝胆外科
作者单位1.北京大学第一医院感染疾病科,100034
2.中山大学达安基因诊断中心
3.上海晶泰生物科技有限公司
推荐引用方式
GB/T 7714
田国保,曾争,黄中红,等. 拉米夫定治疗中乙型肝炎病毒基因序列变异特点及其准种研究[J]. 中华实验和临床病毒学杂志,2011,25(1):23-25.
APA 田国保.,曾争.,黄中红.,陆海英.,于敏.,...&斯崇文.(2011).拉米夫定治疗中乙型肝炎病毒基因序列变异特点及其准种研究.中华实验和临床病毒学杂志,25(1),23-25.
MLA 田国保,et al."拉米夫定治疗中乙型肝炎病毒基因序列变异特点及其准种研究".中华实验和临床病毒学杂志 25.1(2011):23-25.
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