IR@PKUHSC  > 北京大学第一临床医学院  > 感染疾病科
学科主题感染疾病科
APOBEC3酶家族基因多态性在不同族群中的分布
其他题名APOBEC3 gene polymorphisms in different ethnic populations
郑颖颖; 郑金鑫; 曾争; 王芳
关键词载脂蛋白b 基因频率 人种群
刊名中华临床医师杂志(电子版)
2010
DOI10.3969/cma.j.issn.1674-0785.2010.06.005
4期:6页:714-720
文章类型Journal Article
摘要目的 研究载脂蛋白B mRNA 编辑酶催化多肽3(apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide-like 3,APOBEC3)基因多态性在不同人种中的差异情况.方法 使用美国麻省理工大学的tagger server 选择13 个标签单核苷酸多态性(tag-SNP),选择条件等位基因频率>0.05.应用DNA pooling 及焦磷酸测序技术检测153 个中国西北方汉族健康人的13 个tag-SNPs 的等位基因频率,并与其他人种比较.结果 13 个tag-SNP 中,rs9622902 、rs6001364 、rs140324 在不同人种中的等位基因频率分布无统计学意义(P =0.577 、0.643 、0.275 );其余10 个tag-SNPs(rs738814 、rs6001363 、rs2019907 、rs8142051 、rs4820364 、rs6001343 、rs2076101 、rs2016407 、rs9619784 、rs5757428 )在不同人种的等位基因频率分布有统计学意义(P <0.05 ),并且以rs2016407 、rs2076101 、rs5757428 、rs2019907 、rs9619784 的P 值最为显著,分别为2.883 E-23 、6.766 E-20 、9.686 E-10 、6.853 E-08 、2.409 E-07.4 个tag-SNPs(rs2019907 、rs6001343 、rs2076101 、rs2016407 )在亚洲中国人和日本人群中的等位基因分布差异均有统计学意义(P <0.05 ).对于中国人但不同地区来说,rs2076101 、rs2016407 、rs2019907 、rs4820364 这4 个tag-SNPs等位基因分布频率差异也具有统计学意义(P <0.05 ).8 个tag-SNPs(rs738814 、rs8142051 、rs2076101 、rs2016407 、rs5757428 、rs6001363 、rs2019907 、rs4820364 )在亚洲地区人种、祖居北欧和西欧的美国犹他州人、尼日利亚伊巴丹的约鲁巴人三大种族中的等位基因频率具有统计学意义(P <0.05),其中以rs2016407 、rs2076101 、rs5757428 最为显著,P 值分别为1.920 E-19 、5.321 E-17 、9.382 E-11.结论 APOBEC3 SNPs 等位基因多态性在不同人种之间的分布并不完全一致,rs2016407 、rs2076101 、rs5757428 这三个tag-SNPs 在不同人种间的差异性最大.
语种中文
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文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.bjmu.edu.cn/handle/400002259/41971
专题北京大学第一临床医学院_感染疾病科
作者单位北京大学第一医院感染疾病科,100034
推荐引用方式
GB/T 7714
郑颖颖,郑金鑫,曾争,等. APOBEC3酶家族基因多态性在不同族群中的分布[J]. 中华临床医师杂志(电子版),2010,4(6):714-720.
APA 郑颖颖,郑金鑫,曾争,&王芳.(2010).APOBEC3酶家族基因多态性在不同族群中的分布.中华临床医师杂志(电子版),4(6),714-720.
MLA 郑颖颖,et al."APOBEC3酶家族基因多态性在不同族群中的分布".中华临床医师杂志(电子版) 4.6(2010):714-720.
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