IR@PKUHSC  > 北京大学第三临床医学院  > 成形外科
学科主题整形医学
瘢痕疙瘩相关基因的生物信息学分析
其他题名Literature Mining and Bioinformatic Analysis of Dysregulated Genes in Keloid
边曦; 黄琛; 李博仑; 秦泽莲
关键词文献挖掘 生物信息学 瘢痕疙瘩 皮肤
刊名中国微创外科杂志
2012
DOI10.3969/j.issn.1009-6604.2012.05.021
12期:5页:444-449,467
收录类别中国科技核心期刊 ; CSCD
文章类型Journal Article
摘要目的 比较瘢痕疙瘩与正常皮肤的基因表达差异,从分子水平探讨瘢痕疙瘩的发病机制,为临床治疗提供新思路. 方法 用PubMed数据库文献检索瘢痕疙瘩与正常皮肤的差异表达基因,对与瘢痕疙瘩相关的基因进行蛋白-蛋白相互作用网络、生物学通路、基因本体( gene ontology,GO)和功能注释聚类的生物信息学分析. 结果 获得差异表达基因谱8个和文献922篇,筛选瘢痕疙瘩相关基因94个(71个上调,23个下调).86个基因构成蛋白-蛋白相互作用网络,TGFB1、FN1、COLI A1、MMP9、VEGFA、TP53、IL6和MMP2为核心蛋白.瘢痕疙瘩相关基因参与信号转导、肿瘤形成等生物学通路,细胞凋亡、细胞运动等生物过程,形成细胞膜结构和细胞外基质、胶原等组分. 结论 TGFB1、FN1、COLIA1、MMP9、VEGFA、TP53、IL6和MMP2等关键基因,TGF-β信号转导、细胞增殖和凋亡、肿瘤形成相关通路在瘢痕疙瘩的发生发展中可能起重要作用.
语种中文
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文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.bjmu.edu.cn/handle/400002259/68705
专题北京大学第三临床医学院_成形外科
作者单位1.北京大学第三医院成形外科,北京,100191
2.北京大学第三医院中心实验室,北京,100191
推荐引用方式
GB/T 7714
边曦,黄琛,李博仑,等. 瘢痕疙瘩相关基因的生物信息学分析[J]. 中国微创外科杂志,2012,12(5):444-449,467.
APA 边曦,黄琛,李博仑,&秦泽莲.(2012).瘢痕疙瘩相关基因的生物信息学分析.中国微创外科杂志,12(5),444-449,467.
MLA 边曦,et al."瘢痕疙瘩相关基因的生物信息学分析".中国微创外科杂志 12.5(2012):444-449,467.
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